Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI1P08151 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI1P08151 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI1P08151 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI1P08151 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI1P08151 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI1P08151 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI1P08151 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI1P08151 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI1P08151 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI1P08151 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI1P08151 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI1P08151 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI1P08151 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms