Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEBLO76041 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEBLO76041 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEBLO76041 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEBLO76041 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEBLO76041 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEBLO76041 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEBLO76041 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEBLO76041 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEBLO76041 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEBLO76041 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEBLO76041 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms