Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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