Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CCDC78A2IDD5 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CCDC78A2IDD5 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CCDC78A2IDD5 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CCDC78A2IDD5 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CCDC78A2IDD5 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CCDC78A2IDD5 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CCDC78A2IDD5 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CCDC78A2IDD5 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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