Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms