Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNFSF18Q9UNG2 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms