Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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