Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
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