Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms