Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms