Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms