Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms