Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms