Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms