Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 IGFL4-201ENST00000377697 573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC096631.1-202ENST00000440162 917 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC009517.1-201ENST00000454750 570 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AL157823.2-201ENST00000452048 669 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 RNF139-AS1-202ENST00000519861 359 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms