Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 PDZRN3-AS1-203ENST00000608743 780 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 RN7SL638P-201ENST00000494527 290 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms