Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.2 ms