Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms