Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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SEMA6DQ8NFY4 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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SEMA6DQ8NFY4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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