Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZP6

RNF113B, RING finger protein 113B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113BQ8IZP6 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF113BQ8IZP6 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms