Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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WDR53Q7Z5U6 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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WDR53Q7Z5U6 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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WDR53Q7Z5U6 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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WDR53Q7Z5U6 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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WDR53Q7Z5U6 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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WDR53Q7Z5U6 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
WDR53Q7Z5U6 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
WDR53Q7Z5U6 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
WDR53Q7Z5U6 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
WDR53Q7Z5U6 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
WDR53Q7Z5U6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
WDR53Q7Z5U6 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
WDR53Q7Z5U6 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
WDR53Q7Z5U6 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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