Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms