Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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RTL8BQ17RB0 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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RTL8BQ17RB0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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RTL8BQ17RB0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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RTL8BQ17RB0 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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