Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF827Q17R98 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms