Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms