Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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SSX1Q16384 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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SSX1Q16384 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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SSX1Q16384 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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SSX1Q16384 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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SSX1Q16384 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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SSX1Q16384 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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SSX1Q16384 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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SSX1Q16384 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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SSX1Q16384 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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