Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms