Protein–RNA interactions for Protein: Q15596

NCOA2, Nuclear receptor coactivator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA2Q15596 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA2Q15596 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms