Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms