Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PTPRKQ15262 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PTPRKQ15262 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PTPRKQ15262 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PTPRKQ15262 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PTPRKQ15262 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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PTPRKQ15262 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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