Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB39AQ14964 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms