Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL1Q13616 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL1Q13616 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL1Q13616 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CUL1Q13616 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CUL1Q13616 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CUL1Q13616 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CUL1Q13616 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL1Q13616 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CUL1Q13616 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL1Q13616 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL1Q13616 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CUL1Q13616 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CUL1Q13616 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CUL1Q13616 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL1Q13616 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL1Q13616 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL1Q13616 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL1Q13616 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL1Q13616 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL1Q13616 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL1Q13616 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CUL1Q13616 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms