Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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TOP3AQ13472 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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TOP3AQ13472 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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TOP3AQ13472 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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TOP3AQ13472 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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TOP3AQ13472 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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TOP3AQ13472 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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TOP3AQ13472 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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TOP3AQ13472 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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TOP3AQ13472 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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TOP3AQ13472 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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TOP3AQ13472 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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TOP3AQ13472 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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TOP3AQ13472 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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TOP3AQ13472 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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TOP3AQ13472 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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