Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IKZF1Q13422 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms