Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms