Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RAB40BQ12829 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RAB40BQ12829 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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RAB40BQ12829 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB40BQ12829 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB40BQ12829 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB40BQ12829 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB40BQ12829 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB40BQ12829 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB40BQ12829 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB40BQ12829 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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RAB40BQ12829 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB40BQ12829 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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RAB40BQ12829 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB40BQ12829 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB40BQ12829 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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