Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SREBF2Q12772 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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