Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms