Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms