Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms