Protein–RNA interactions for Protein: Q01113

IL9R, Interleukin-9 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL9RQ01113 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL9RQ01113 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms