Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms