Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms