Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ACTBP60709 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ACTBP60709 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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