Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
POLR2KP53803 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms