Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME1P48163 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms