Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms