Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APOBEC1P41238 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms