Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms