Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HOXD12P35452 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HOXD12P35452 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HOXD12P35452 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HOXD12P35452 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HOXD12P35452 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HOXD12P35452 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HOXD12P35452 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HOXD12P35452 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HOXD12P35452 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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